Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Sh3bp2Q06649 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp2Q06649 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms