Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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Sh3bp1P55194 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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