Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Hoxd9P28357 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Hoxd9P28357 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Hoxd9P28357 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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