Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Cldn34c2J3QNM1 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Cldn34c2J3QNM1 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn34c2J3QNM1 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms