Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rtf1A2AQ19 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms