Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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