Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms