Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trafd1Q3UDK1 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms