Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cpne9Q1RLL3 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cpne9Q1RLL3 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms