Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Sh3bp1P55194 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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Sh3bp1P55194 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Sh3bp1P55194 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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