Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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