Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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