Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms