Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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