Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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