Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ubash3bQ8BGG7 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms