Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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