Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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