Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rpusd2Q149F1 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rpusd2Q149F1 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms