| Hoxd1 | Q01822 | AC098719.1-201 | ENSMUST00000228920 | 371 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Znrd1as-201 | ENSMUST00000040177 | 976 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr943-201 | ENSMUST00000071617 | 1079 nt | APPRIS P2 TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25200-201 | ENSMUST00000083094 | 130 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir181a-2-201 | ENSMUST00000083489 | 76 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37655-201 | ENSMUST00000193968 | 4123 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Dst-203 | ENSMUST00000115104 | 23279 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Dst-201 | ENSMUST00000097785 | 23251 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14325-201 | ENSMUST00000108939 | 1576 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37661-201 | ENSMUST00000191863 | 1550 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC153801.2-201 | ENSMUST00000219875 | 3372 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr354-202 | ENSMUST00000217479 | 9539 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr769-202 | ENSMUST00000215453 | 4143 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Ghr-208 | ENSMUST00000161561 | 2749 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 0610010F05Rik-201 | ENSMUST00000043356 | 4392 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Trbv5-201 | ENSMUST00000103266 | 368 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm11939-201 | ENSMUST00000104931 | 300 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | BE692007-203 | ENSMUST00000189306 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm33354-201 | ENSMUST00000195448 | 906 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | AC152979.1-201 | ENSMUST00000218214 | 289 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm8785-201 | ENSMUST00000220259 | 487 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm20102-201 | ENSMUST00000222445 | 220 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | CT030254.2-201 | ENSMUST00000225902 | 502 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Skint11-201 | ENSMUST00000079915 | 820 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24460-201 | ENSMUST00000082731 | 106 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mga-202 | ENSMUST00000079934 | 13304 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr183-201 | ENSMUST00000073320 | 2040 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Phex-201 | ENSMUST00000079945 | 6265 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Tbx22-201 | ENSMUST00000068451 | 2947 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1309-203 | ENSMUST00000214935 | 5448 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Pramel6-202 | ENSMUST00000111572 | 1781 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Ifi208-201 | ENSMUST00000085876 | 2990 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Nbdy-205 | ENSMUST00000208235 | 132 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm7675-201 | ENSMUST00000208828 | 686 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm39348-202 | ENSMUST00000217239 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AF357341-201 | ENSMUST00000083088 | 75 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23096-201 | ENSMUST00000083447 | 107 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Klra3-201 | ENSMUST00000088017 | 984 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1280-203 | ENSMUST00000219291 | 6883 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC124562.2-201 | ENSMUST00000223888 | 2313 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Adgre4-201 | ENSMUST00000025004 | 3491 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Erbin-205 | ENSMUST00000188997 | 5084 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43751-201 | ENSMUST00000200275 | 3071 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Svs2-201 | ENSMUST00000044953 | 1695 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm42536-201 | ENSMUST00000197562 | 1613 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1183-203 | ENSMUST00000219871 | 8353 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Zfp992-201 | ENSMUST00000105733 | 4550 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37761-201 | ENSMUST00000194989 | 2098 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22758-201 | ENSMUST00000102275 | 96 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Igkv14-111-201 | ENSMUST00000103320 | 368 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Klrc2-203 | ENSMUST00000118401 | 707 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13064-201 | ENSMUST00000119125 | 557 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Klrc2-204 | ENSMUST00000119533 | 717 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22479-201 | ENSMUST00000122566 | 81 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24385-201 | ENSMUST00000122694 | 350 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12505-201 | ENSMUST00000146041 | 757 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |