Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Hoxd1Q01822 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Hoxd1Q01822 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms