Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Irf5P56477 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Irf5P56477 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Irf5P56477 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Irf5P56477 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irf5P56477 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms