Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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