Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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