Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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