Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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