Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Pggt1bQ8BUY9 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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