Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms