Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sh3bp2Q06649 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Sh3bp2Q06649 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms