Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sh3bp1P55194 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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