Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtpreP49446 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtpreP49446 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PtpreP49446 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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