Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxd9P28357 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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