Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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Ccl20O89093 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccl20O89093 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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