Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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