Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Snx5Q9D8U8 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Snx5Q9D8U8 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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