Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Cldn16Q925N4 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn16Q925N4 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn16Q925N4 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn16Q925N4 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn16Q925N4 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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