Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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ptchd1Q14B62 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ptchd1Q14B62 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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