Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Sh3bp1P55194 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Sh3bp1P55194 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sh3bp1P55194 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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