Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd10P28359 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms