Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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Hoxd9P28357 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Hoxd9P28357 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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