Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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