Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Cldn4O35054 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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