Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Casq1O09165 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms