Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NebE9Q1W3 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms