Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Brpf1B2RRD7 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Brpf1B2RRD7 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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