Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Limd1Q9QXD8 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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