Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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