Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms