Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shmt2Q9CZN7 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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