Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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