Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SrrtQ99MR6 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SrrtQ99MR6 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms